VisualStudio2012で.Net Framework 3.5 を指定するための方法
こちら
http://www.ruche-home.net/boyaki/2012-10-14/CCLIVisu
や
Visual Studio 2012 C++で.NET Framework 4.0 以前をターゲットする方法 - コード スペランカー
こちらで書かれている TargetFramework エレメントが*.vcxprojの中に発見できなくて困っていましたが、
https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/vstudio/ff770576(v=vs.110).aspx
こちらを見ると
<Project> の要素の <PropertyGroup Label="Globals">
に
<TargetFrameworkVersion>バージョン番号</TargetFrameworkVersion>
を差し込めば良いとのことでした。